文件名称：wustl_docker:与Docker相关的文件可满足WUSTL项目的计算需求
文件大小：40KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-07 22:16:50
Shell
在WUSTL为项目构建Docker映像 细胞游侠（10x Genomics） DockerFile_cellranger-6.0.1 拉取构建的映像： docker pull julianqz/cellranger-6.0.1:latest 用于计算免疫学的定制图像 DockerFile_JZ_v1 建立在jupyter/datascience-notebook 其他Python库： scanpy ， presto ， changeo 其他R软件包： alakazam ， shazam ， tigger ， scoper （通过install_R_pkgs.R ） 附加库/软件包的版本设置为固定，并在work/docker_build_info.txt中报告 install_R_pkgs.R 安装versions （对于versions::available:versions
【文件预览】：
wustl_docker-main
----DockerFile_cellranger-6.0.1(2KB)
----DockerFile_ubuntu_lsf(235B)
----wu_cimm()
--------wu_cimm_dowser.R(701B)
--------wu_cimm_imm.R(470B)
--------wu_cimm_seurat.R(450B)
--------wu_cimm_dockerfile(3KB)
----install_R_pkgs.R(1KB)
----DockerFile_JZ_v1(2KB)
----wu_presto()
--------pipelines()
--------protocols()
--------scripts()
--------wu_presto_r.R(545B)
--------wu_presto_dockerfile(4KB)
----README.md(1KB)
----wu_base()
--------wu_base_r.R(913B)
--------wu_base_dockerfile(1KB)
----.gitignore(20B)
----DockerFile_ubuntu_main(305B)