文件名称：pinetree:Pinetree - 一种植物 miRNA 靶标浏览器
文件大小：69KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-30 05:17:25
C
PINETREE - 由 Manuel Reis 1.0 版开发的植物 miRNA 目标浏览器 在本地配置要运行的程序： bash 配置文件 要运行搜索程序，只需键入： ./pinetree -t path/to/transcript/file -m path/to/mirna/file 要运行反目标评分程序，请键入： ./pinetree_evo -t path/to/transcript/file -m path/to/mirna/file 您可以直接在脚本中修改其他参数，或者使用 CONFIG 文件。 如果您需要有关可以使用的参数的更多信息，只需键入： ./松树* -h
【文件预览】：
pinetree-master
----constants.h(2KB)
----evo.h(830B)
----model.h(2KB)
----accessibility.c(2KB)
----fasta.h(164B)
----strmap.h(13KB)
----RNAup_cmdl.h(17KB)
----fasta.c(1KB)
----RNAup_cmdl.c(72KB)
----pinetree.c(7KB)
----pinetree_evo.c(2KB)
----configure.sh(459B)
----pinetree_evo_cmdl.c(5KB)
----accessibility.h(349B)
----RNAup.h(404B)
----align.c(7KB)
----pinetree_utils.h(759B)
----util.c(7KB)
----CONFIG(371B)
----LICENSE(3KB)
----dataset.c(811B)
----config.h(4KB)
----model.c(7KB)
----types.h(128B)
----README.md(549B)
----pinetree_cmdl.c(9KB)
----pinetree_cmdl.h(249B)
----strmap.c(15KB)
----util.h(1010B)
----makefile(1KB)
----annotation.h(232B)
----RNAup.c(39KB)
----align.h(1KB)
----dataset.h(295B)
----.gitignore(385B)
----pinetree_evo_cmdl.h(230B)
----annotation.c(629B)
----evo.c(5KB)
----pinetree_utils.c(2KB)