文件名称：cooler:存放Hi-C的好地方
文件大小：10.84MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-05 19:31:30
python bioinformatics genomics file-format contact-matrix
冷却器 存放Hi-C的好地方 Cooler是稀疏，压缩的二进制持久存储（也称为cooler）的支持库，用于存储基因组交互数据，例如Hi-C联系人矩阵。 较凉的文件格式是使用作为容器格式的基因组矩阵数据模型的实现。 cooler软件包包括一套和一个以方便创建，查询和操作cooler文件。 开始： 冷却器 阅读并查看Jupyter Notebook演练。 可从ftp://cooler.csail.mit.edu/coolers获得来自已发布的Hi-C数据集的超酷文件。 4DN数据门户网站上提供了更多的multires（ mcool ）文件。 安装 使用pip从PyPI安装。 $ pip install cooler 如果您使用的是conda ，则可以从bioconda通道安装cooler 。 $ conda install -c conda-forge -c bioconda