文件名称：fastq_download_fr_acc_list
文件大小：57KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-04 23:45:04
Shell
fastq_download_fr_acc_list 这仅适用于配对末端读取。 对于单端，需要修改inner_sra.sh文件。 清理文件夹rm -rf batch / * err / * temp / * down *，然后复制整个父文件夹以进行其他研究。 将特定的acc.txt文件替换到该文件夹。 sh batch.sh生成批处理文件。 sh Submit.sh将fastq文件下载到临时文件夹。 下载完成后，清除错误文件。 mv down * err / 如果您要下载的样本很多， 修改submit.sh文件以设置等待时间（秒） 每次提交作业之间的时间间隔，以避免HPC过多。
【文件预览】：
fastq_download_fr_acc_list-main
----inner_script.sh(636B)
----acc.txt(48B)
----acc_total.txt(274KB)
----batch.sh(804B)
----README.md(619B)
----submit.sh(52B)