snakemake_multiqc:在蛇形设计中使用multiQC的示例

时间:2024-03-26 08:30:48
【文件属性】:

文件名称:snakemake_multiqc:在蛇形设计中使用multiQC的示例

文件大小:2KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-26 08:30:48

Python

snakemake_multiqc 这是一个简单,可重现的示例,其运行fastqc,然后使用测试fastq文件在Snakemake工作流程中运行multiqc。 要运行该示例,请从工作目录中运行以下命令,并确保在本地系统或蛇形特定的conda环境中的系统上安装了Snakemake: git clone --recursive https://github.com/jakevc/snakemake_multiqc.git cd snakemake_multiqc snakemake --use-conda fastqc和multiqc结果将在data子目录中生成。


【文件预览】:
snakemake_multiqc-master
----.gitmodules(115B)
----envs()
--------qc.yml(101B)
----ngs-test-data()
----README.md(599B)
----Snakefile(824B)
----.gitignore(11B)

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