【文件属性】:
文件名称:关联规则的matlab代码-pfp:Matlab函数用于蛋白质功能预测
文件大小:166KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-24 09:44:39
系统开源
关联规则的matlab代码PFP
用于蛋白质功能预测的MATLAB库。
该软件包中的Matlab函数使用“
pfp_
”(也称为蛋白质功能预测)作为文件名前缀。
常用数据结构
ONT
,本体结构,请参阅。
此结构具有以下字段:
必填字段:
term
:术语结构列表(
id
,
name
)。
rel_code
:关系代码的列表,例如{
is_a
,
part_of
}。
DAG
:关系矩阵DAG(i,
j)
=
k
(k>0)表示term(i)与rel_code
(
rel_code与term(j)的第k个关系。
ont_type
:本体类型,例如molecular_function
。
date
:此结构的构建日期。
可选字段:
alt_list
:替代术语ID列表。
OA
(本体注释结构),请参阅。
此结构具有以下字段:
必填字段:
object
:对象(序列)列表。
ontology
:相关的本体结构。
annotation
:注解矩阵,
annotation(i,
j)
=
1表示对象(i)用term(j)注解。
date
:此结构的构建日期。
预测结构PRED
,请参阅(通过