文件名称：Gillespie Stochastic Simulation Algorithm：模拟化学React网络的离散随机模型。-matlab开发
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更新时间：2024-06-21 03:58:54
matlab
化学React网络的动力学通常使用微分方程建模，将化学物质的数量视为连续和确定性的数量。 如果React分子的数量很少，随机分子波动就会变得显着，离散、随机建模方法通常更合适。 在“混合良好”环境的假设下，这样的系统可以建模为连续时间马尔可夫过程，其概率分布遵循所谓的化学“主方程”。 Gillespie 算法（或 SSA）是一种离散事件模拟算法，它生成与主方程在统计上完全一致的随机过程的单一实现。 此提交包括两个原始版本的 SSA（直接和第一React方法）的简单实现。 用户提供由React化学计量矩阵、计算React倾向（概率/单位时间）的函数句柄、初始状态向量和初始/最终时间组成的模型。 ssa 函数返回事件时间和物种数量的序列。
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ssa.zip