【文件属性】：
文件名称：matlab分时代码-multi-DDM:多DDM
文件大小：67KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-21 20:11:43
系统开源
matlab分时代码多DDM分析
该文件提供了使用随附的MATLAB函数在一系列视频上运行多DDM的简单指南。
尽管此软件包中的代码已开发为在ALI文化下分析纤毛上皮的视频，但multi-DDM是一种更为通用的技术，可以在多种情况下使用。
此代码提交是以下出版物的补充信息的一部分：
Chioccioli，M.
*，Feriani，L.
*，Kotar，J.，Bratcher，PE†，Cicuta，P.†，“囊性纤维化呼吸道上皮细胞对CFTR调节剂的纤毛动力学和协同作用的表型分析”，《自然通讯》
（2019）。
相反，首先介绍多DDM的论文是：
安装
此代码取决于一些MATLAB工具箱。
你会需要：
图像处理工具箱
并行计算工具箱
曲线拟合工具箱
信号处理工具箱
确保满足以上依赖性后，下载或克隆此存储库，然后。
原始视频上的Multi-DDM
在分析流程的第一步中，将在每个（输入）原始视频上独立运行multi-DDM。
在此步骤结束时，每个输入视频文件都会有一个MATLAB
.mat文件，其中包含multi-DDM的结果。
为此，请运行函数Analyse_Epithelix_func
。
【文件预览】：
multi-DDM-master
----prepare_accumdata_for_sigmoids.m(2KB)
----license.txt(1KB)
----common_functions()
--------setsemilogx.m(214B)
--------avi2greyscaleframestack.m(622B)
--------par_confint.m(587B)
--------structstruct.m(4KB)
--------cprintf.m(23KB)
--------moviereader.m(33KB)
--------isinrange.m(540B)
--------cch.m(20B)
--------minmax.m(202B)
----videoreaders()
--------OmeReaderWrapper.m(6KB)
--------VideoReaderWrapper.m(4KB)
--------select_video_reader.m(850B)
--------MovieReaderWrapper.m(2KB)
----parameters()
--------calibrated_magnifications.json(193B)
--------parameters.json(40B)
----plot_data.m(3KB)
----.gitignore(6B)
----multiddm_functions()
--------populate_DDM_Sigmoids_struct.m(9KB)
--------plot_single_sigmoid_errorbar.m(4KB)
--------DDM_core.m(4KB)
--------DDM_Analysis.m(48KB)
--------multiDDM_core.m(7KB)
--------extract_data_for_sigmoids.m(12KB)
--------magnification_to_micronsperpixel.m(2KB)
--------merge_SampleType_data.m(8KB)
--------plot_single_CBF_histogram.m(3KB)
--------fit_Iqtau_ourcilia.m(6KB)
----Analyse_Epithelix_func.m(15KB)
----README.md(6KB)
----tests.m(2KB)