文件名称：HoneyBADGER:HMM集成贝叶斯方法，用于从单细胞RNA序列数据中检测CNV和LOH事件
文件大小：46.63MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-30 12:46:46
hmm bioinformatics bayesian transcriptomics subpopulation
HoneyBADGER （为hidden马尔可夫模型集成乙ayesian为d etecting从罪克CNV和LOH事件接近角勒-CÊLL - [R NA-SEQ的数据）识别和推断的单个细胞中的CNV和LOH事件的存在和重构使用亚克隆架构单细胞RNA测序数据中的等位基因和表达信息。 以下出版物详细介绍了总体方法： 利益与能力 （1）迭代HMM方法检测CNV （2）贝叶斯分层模型使用等位基因和表达数据推断单个细胞中CNV的概率 （3）从转录数据推断CNV可以实现亚克隆的转录表征和其他综合分析 请访问HoneyBADGER以获取更多教程和信息。 安装 要安装HoneyBADGER ，我们建议使用devtools ： require(devtools) devtools::install_github('JEFworks/HoneyBADGER') HoneyBADGER使用JAGS