文件名称:MITObim:MITObim - 线粒体诱饵和迭代映射
文件大小:19.21MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-20 08:28:16
Perl
MITObim - 线粒体诱饵和迭代映射 版本 1.9.1(稳定 - 依赖于 MIRA 4.0.2)这个版本存档在 Zenodo 上: 1.6(稳定 - 依赖于 MIRA 3.4.1.1) 我们建议使用最新版本,但请参阅下面有关校对算法可用性的说明。 版权所有 Christoph Hahn 2012-2018 接触 我们鼓励用户将您对MITObim的任何疑问/意见/问题发布到我们的网上或。 或(在紧急情况下) 直接通过联系我。 我会尽量尽快回复你! 如果几天之内没有收到我的回音,请再发送一次提醒! 介绍 本文档包含有关如何使用 Hahn 等人中描述的 MITObim 管道的说明。 2013 年。完整的文章可以在找到。 如果您在工作中使用 MITObim,请引用这篇文章。 该管道最初是为Illumina数据开发的,但由于 MIRA 组装器的多功能性,MITObim 原则上也支持
【文件预览】:
MITObim-master
----old()
--------MITObim_1.6.pl(31KB)
----misc_scripts()
--------get_wiggle.pl(5KB)
--------interleave-fastqgz-MITOBIM.py(1KB)
--------downsample.py(7KB)
--------circules.py(14KB)
----LICENSE(1KB)
----devel()
--------MITObim.pl(43KB)
----docker()
--------testdata()
--------external_software()
--------Dockerfile(1KB)
--------README.md(588B)
--------scripts()
----examples()
--------README.md(314B)
--------notebooks()
----.gitignore(5B)
----MITObim.pl(43KB)
----README.md(23KB)
----testdata1.tgz(278KB)