文件名称：DEA_and_fit：执行差异表达分析，拟合结果并对杂交基因表达进行分类
文件大小：1.5MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-09 04:47:35
R
DEA_and_fit 考虑到整个Eukarya遗传补体的变异程度，基因表达模式的跨王国比较不能像比较代表性系统的读取计数矩阵那样简单。 相反，可以将亲本[亲本基因与亲本基因]和杂种[亲本来源的基因拷贝与亲本来源的基因拷贝]的差异表达分析结果相结合，以形成可以在不同王国进行比较的五个表达类别。 简而言之，这些表达类别为： 父母亲差异表达遗传（PEI de）：在杂交物中保持父母亲表达偏倚。 父母平等表达继承（PEI eq）：平等父母表达被杂种继承。 同源同源表达混合（HEB1）：在杂种中失去亲本表达偏见。 同源表达偏倚（HEBi）：杂种表达偏倚源于无父母偏倚。 同源同源物表达逆转（HER）：亲本中的表达偏差在杂种中逆转。 有关这些类的更多信息，请参见以下出版物： 考克斯（Cox），国会*（MP），董德（T.Dong），申G.沉（S. 2014年。种间真菌杂种揭示了异源多倍
【文件预览】：
DEA_and_fit-master
----functions.R(8KB)
----README.md(5KB)
----files()
--------HH_p_hylite.G_arboreum_x_raimondii.G_HH_rep2.read.summary.txt(1.94MB)
--------sub_classes_df.txt(1.27MB)
--------HH_p_hylite.G_arboreum_x_raimondii.G_HH_rep1.read.summary.txt(1.94MB)
--------HH_p_hylite.expression.txt(1.94MB)