文件名称:功能区:#golang中蛋白质的功能区图
文件大小:306KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-02-21 15:28:43
go chemistry protein-data-bank protein biochemistry
蛋白带图 解析PDB文件并以纯Go语言渲染蛋白质的带状图。 安装 应该安装并设置GOPATH (在Go 1.8+中默认为$HOME/go )。 如果要轻松运行二进制文件,则$GOPATH/bin应该在$PATH 。 $ go get -u github.com/fogleman/ribbon/cmd/rcsb 用法示例 提供一个4位数的RCSB结构ID。 PDB文件将自动下载并渲染图像。 三角形网格也将被保存。 $ rcsb 4hhb # generates 4hhb.png and 4hhb.stl 资源资源 -在此处查找蛋白质的PDB文件。 数据库中超过100,000。 -有关PDB文件格式的详细信息。 软件包pdb pdb软件包分析PDB文件。 当前分析了以下实体: ATOM => *pdb.Atom HETATM => *pdb.Atom CONECT => *pdb.Connection HELIX => *pdb.Helix SHEET => *pdb.Strand BIOMT => pdb.Matrix SMTRY => pdb.Matrix 此外,
【文件预览】:
ribbon-master
----.gitignore(19B)
----README.md(2KB)
----pdb()
--------residue.go(1KB)
--------atom.go(2KB)
--------reader.go(3KB)
--------chain.go(636B)
--------matrix.go(150B)
--------strand.go(4KB)
--------connection.go(434B)
--------model.go(964B)
--------util.go(321B)
--------reader_test.go(605B)
--------helix.go(2KB)
----scripts()
--------profile.go(624B)
--------main.go(6KB)
--------test.go(1KB)
--------ride.go(2KB)
--------structures.txt(624KB)
----LICENSE.md(1KB)
----ribbon()
--------mesh.go(6KB)
--------peptideplane.go(1KB)
--------camera.go(4KB)
--------spline.go(2KB)
--------ribbon.go(8KB)
--------colormap.go(7KB)
--------element.go(7KB)
--------util.go(301B)
----cmd()
--------lines()
--------rcsb()
--------surface()