文件名称：循环分析脚本
文件大小：2KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-01 11:00:36
循环分析脚本 完整的分析流程 注意：将所有文件（包括.bedpe文件和hg38 gff文件）保留在一个目录中。 对于python脚本和Linux终端，请将其用作工作目录。 依赖关系：bedtools，Python> = 3.7，pandas> = 1.2.0 要复制此分析， 运行Common_Loop_generator.py脚本（最好在python IDE中运行）。 输出应该是一组.bed文件。 在Linux终端中运行以下命令： bedtools window -a anyLoops_AML_1.bed -b hg38.gff -w 15000 > mapped_anyLoops_AML_1.csv bedtools window -a anyLoops_AML_2.bed -b hg38.gff -w 15000 > mapped_anyLoops_AML_2.csv bed
【文件预览】：
Loop-analysis-scripts-main
----README.md(4KB)