文件名称:BioSummer:2015.癌症分类
文件大小:43.14MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-07 22:36:40
javascript svm adaboost JavaScript
基于体细胞突变数据的癌症类型分类器的构建。 数据库的.maf文件用作初始数据。 这些文件位于Data目录中 动作逻辑: 加载(有向加权图)。 肋骨重量计算为基因之间所有可能的总和除以10(归一化) 创建表格:行-患者数据,列-有关特定基因的数据。 该表根据重要性进行填写(有关更多信息,请参见下文)。 G0 :排序-> AdaBoost-> SVM G1 :排序->网络-> AdaBoost-> SVM G2 :排序->网络->网络-> AdaBoost-> SVM 排序:根据所有患者中给定基因的突变总数,对表格(基因)的列进行排序。 因此,最频繁突变的基因排在第一位。 AdaBoost:使用AdaBoost算法学习表格的前2000个基因。 SVM:对通过AdaBoost获得的具有非零贡献的所有基因进行SVM训练。 网络:对于每个基因(A),我们都有其重要性(k)和网络中
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BioSummer-master
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