sequence-aligner

时间:2024-06-13 09:28:11
【文件属性】:

文件名称:sequence-aligner

文件大小:118KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-13 09:28:11

JavaScript

序列比对向导 关于 简单的应用程序可以比对两个序列。 使用PostgreSQL,Node.js,Express和React创建,并使用Needleman-Wunsch算法进行全局对齐。 在此处查看其运行情况: : 介绍 序列比对具有许多应用,包括系统发育分析,基因组组装和NLP。 尽管此比对工具可与按字母数字方式绘制的任何序列一起使用,但在生物学中,我们对DNA或蛋白质序列感兴趣。 DNA序列由腺嘌呤,胞嘧啶,胸腺嘧啶和鸟嘌呤的字母A,C,T和G表示,而蛋白质序列包含20个氨基酸的表示。 由于序列可能不相同,所以比对可以包括插入缺失突变(插入或缺失)或取代。 例如,给定序列GCTAATCCCGG和CATCATGGA,可能的比对可能包括: GCTAATCCCGG- |||||||||||| ---CATCATGGA 或者 GCTAATCCCGG ||||||||||| -CAT


【文件预览】:
sequence-aligner-master
----.gitignore(63B)
----README.md(1KB)
----tests()
--------client.spec.js(2KB)
--------api.spec.js(1KB)
--------db.spec.js(1KB)
----main.js(331B)
----server()
--------public()
--------db()
--------api()
--------index.js(814B)
--------utils.js(330B)
----package.json(2KB)
----client()
--------components()
--------aligner.js(2KB)
--------index.js(150B)
----webpack.config.js(448B)
----babel.config.js(126B)
----package-lock.json(424KB)

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