ROSETTA_EM_REFINEMENT:Rosetta中的EM优化脚本

时间:2024-05-19 12:38:35
【文件属性】:

文件名称:ROSETTA_EM_REFINEMENT:Rosetta中的EM优化脚本

文件大小:8KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-19 12:38:35

Python

ROSETTA_EM_REFINEMENT Rosetta中的EM优化脚本 launch_rosetta_local.py-定义用于密集采样的区域(在脚本中,可能应该移至参数)launch_rosetta_global.py-本质上是用于全局优化的教程命令 感谢Gabe Lander和Mark Herzik(特别是密度加权的作者)和Ray Wang(其他建议) 处理赖氨酸乙酰化 (改编自 ) 将lys_acetylated.txt移动到数据库/chemical/residue_type_sets/centroid/patches/lys_acetylated.txt 将以下行添加到数据库/chemical/residue_type_sets/centroid/patches.txt中:patch / lys_acetylated.txt 将残基名称从ALY编辑为LYS 其他说明:


【文件预览】:
ROSETTA_EM_REFINEMENT-master
----launch_idealize.py(693B)
----LICENSE(1KB)
----lys_acetylated.txt(224B)
----launch_rosetta_local.py(5KB)
----README.md(2KB)
----new_multi.xml(3KB)
----launch_rosetta_global.py(5KB)
----new_multi_ray.xml(2KB)

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