文件名称：AMBER10_Brownian_Dynamics:专为粗粒蛋白质缔合模拟而设计-开源
文件大小：1.32MB
文件格式：TGZ
更新时间：2024-06-15 20:46:40
开源软件
休斯顿大学的Cheung组（https://mynsm.uh.edu/wiki/projects/cheunggroup/）基于AMBER10的SANDER源代码，一直在努力进行粗粒蛋白质模型的分子模拟。 该代码现已发布，以促进蛋白质-蛋白质缔合模拟的研究。 该代码包括用于粗粒度模型的其他汉密尔顿术语（如http://www.pnas.org/content/110/51/20545.abstract中所述），并使用由Northup-Allison-Mccammon开发的算法。 该代码与MPI并行化，并允许在很大的ms时间内进行关联。 用户需要具有一套完整的amber10代码才能应用此修改。