文件名称：sctools:用于大规模分布式单细胞数据处理的实用程序
文件大小：16.11MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-11 14:22:03
Python
单细胞工具 Single Cell Tools提供用于处理序列数据格式的实用程序，适用于分析大型生物数据集的分布式系统。 下载及安装 凳子包 sctools软件包提供了命令行实用程序和设计用于python程序的类。 命令行实用程序 Attach10XBarcodes：附加的条形码存储在fastq文件中，以读取未对齐的bam文件 SplitBam：将bam文件拆分为多个块，确保将单元格包含在1个块中 CalculateGeneMetrics：计算有关实验或组块中基因的信息 CalculateCellMetrics：计算有关实验或块中细胞的信息 MergeGeneMetrics：合并从实验的不同部分计算得出的基因指标 MergeCellMetrics合并根据实验的不同部分计算得出的单元格指标 主要包装类别 平台：一个抽象类，为不同的3'测序格式定义了通用的数据结构。 此程序包中所有旨在处理