文件名称：Archive:存档所有工具和管道
文件大小：8KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-26 13:02:58
档案 InteractiVenn ：用于创建维恩图的工具。 FigTree ：以图形方式查看系统发育树的工具。 FastANI ：计算全基因组平均核苷酸身份（ANI）。 Kostas_lab_ANI ：使用两个基因组数据集之间的最佳匹配（单向ANI）和相互匹配的最佳匹配（双向ANI）来估计平均核苷酸同一性。 MAFFT ：用于基于渐进比对算法创建多序列比对的工具。 Mauve ：基于渐进式比对和比对显示创建多序列比对的工具。 Prokka ：快速的原核基因组注释。 Roary ：计算泛基因组和核心基因组。 Snippy ：找到单倍体参考基因组和序列分离物之间的SNP。 RAxML ：系统发育树的构建（最大可能性）。 SplitsTree ：计算系统发育网络。 ncbi-blast + ：本地数据库的构建和检索。 GGDC ：计算机内DNA DNA杂交（DDH）。
【文件预览】：
Archive-main
----README.md(1021B)
----TOOLS()
--------SplitsTree.txt(383B)
--------prokka.txt(655B)
--------GGDC.txt(934B)
--------TYGS.txt(728B)
--------Kostas_lab_ANI.txt(918B)
--------Snippy.txt(1KB)
--------RAxML.txt(311B)
-------- InteractiVenn.txt(748B)
--------ncbi-blast+.txt(868B)
--------MAFFT.txt(360B)
--------FastANI.txt(1KB)
--------FigTree.txt(177B)
--------Mauve.txt(469B)
--------Roary.txt(899B)