snp_tools:一套用于SNP分析的工具和附加组件

时间:2024-05-24 20:33:55
【文件属性】:

文件名称:snp_tools:一套用于SNP分析的工具和附加组件

文件大小:53KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-24 20:33:55

Perl

snp_tools 一套用于SNP分析的工具和附加组件 ## Introduction工具和附加组件,主要用于处理的输出, 是无对齐的SNP识别软件包。 ksnp_matrix_filter.pl和ksnp_matrix_to_diff_matrix.pl的基本功能将对任何以fasta格式对齐的序列起作用。 ## Requirements所有软件包都是用Perl编写的,并且需要bash shell。 以下先决条件必须在您的PATH中可用才能起作用。 全部必需: 重击 Perl 一些(ksnp_snp_confirm.pl,kmer_core.pl,kmer_compare.pl)必需: (> = v1.1.2)。 如果您有kSNP,则可能已经安装了该文件,并且已在您的路径中。 对于某些是可选的: gzip ##安装只需下载包含脚本的文件夹并将其放在可以找到它的位置。 重要说


【文件预览】:
snp_tools-master
----ksnp_matrix_to_diff_matrix.pl(12KB)
----lib()
--------kmer_compare_split_mt.pl(4KB)
--------kmer_compare_filter_mt.pl(9KB)
--------kmer_core_mt_merge.pl(5KB)
--------kmer_compare_pairwise_mt.pl(9KB)
--------ksnp_snp_confirm_batch.correct_mt.pl(4KB)
----kmer_core.pl(20KB)
----LICENSE(34KB)
----kmer_compare.pl(24KB)
----README.md(17KB)
----ksnp_snp_confirm.pl(12KB)
----ksnp_matrix_filter.pl(11KB)
----kmer_compare_groups.pl(7KB)

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