文件名称:MATLAB用拟合出的代码绘图-mtlipglm:Yates等人的分析代码。(2017)
文件大小:101KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-10 10:48:07
系统开源
MATLAB用拟合出的代码绘图MT LIP GLM 该回购提供了用于Yates等人进行分析的MATLAB代码。 (2017) 入门/安装 安装代码 通过克隆或下载zip创建mtlipglm的本地副本 git clone https://github.com/jcbyts/mtlipglm 您还需要NeuroGLM代码的classy分支 git clone https://github.com/jcbyts/neuroGLM cd neuroGLM git checkout classy 获取数据 没有数据的本地副本,代码将无法运行。 要从手稿中快速复制图形,需要数据和已装配的GLM。 由于所有数据和数据占用了相当数量的磁盘空间,因此有很多选择。 您可以通过#1或#2下载数据,然后自己进行调整,或者也可以通过下载#3来快速复制图5。 如果下载了拟合, main_fits和lip_trunc_fits移至神经元和刺激所在的目录。 mtlipglm代码将假定它们都在同一基本目录中。 跑步前 注意:此代码仅在MATLAB 2015b及更高版本上经过测试。 设置路径 打开Matlab。
【文件预览】:
mtlipglm-master
----addMTLIPpaths.m(591B)
----code()
--------dependencies()
--------getColors.m(548B)
--------binTrialEvent.m(1KB)
--------computeCohPSTH.m(3KB)
--------computePTA.m(3KB)
--------expfun.m(166B)
--------GaborDotsNotes.m(13KB)
--------plotArrow.m(5KB)
--------rsquared.m(139B)
--------pulseSTA.m(3KB)
--------logliPoisson.m(227B)
--------@neuro()
--------computeChoPSTH.m(831B)
--------glmspike.m(52KB)
--------cbrewer.m(6KB)
--------cbrewerlicense.txt(1KB)
--------tight_subplot.m(2KB)
--------getNeuronPrefDir.m(1KB)
--------dprime.m(214B)
--------binSpTimes.m(1KB)
--------getNeuronDeltaPref.m(750B)
--------mtlipglm.m(50KB)
--------mergefield.m(622B)
--------getDeltaTuning.m(402B)
--------getCP.m(2KB)
--------eventPsth.m(2KB)
--------funh2struct.m(1KB)
--------colorbrewer.mat(5KB)
--------pmfTools.m(35KB)
--------findFile.m(2KB)
--------errorbar2D.m(389B)
--------binContinuous.m(539B)
--------reader.m(1KB)
--------errorbarBin.m(482B)
--------percentcorrectSDT.m(65B)
--------loadUpFits.m(561B)
--------rcgreader.m(3KB)
--------getExperimentIndices.m(748B)
--------roc.m(1KB)
--------getNeurons.m(512B)
--------README.md(1KB)
--------getStim.m(211B)
--------parsave.m(307B)
--------getMTLIPcolors.m(564B)
--------plot_brewer_cmap.m(2KB)
--------repnan.m(2KB)
--------struct2funh.m(2KB)
--------bitsPerSpike.m(327B)
--------upsampleFilters.m(297B)
--------upsampleEyepos.m(1KB)
--------saccadeDetector.m(6KB)
--------pulseSTASingle.m(2KB)
--------getExperimentsAnd.m(315B)
--------getAllNeurons.m(415B)
--------diffCirc.m(252B)
--------getSingleGabor.m(841B)
--------empiricalNonlinearity.m(960B)
--------eventTriggeredAverage.m(1KB)
----analysis_scripts()
--------cmdFitLIP.m(3KB)
--------cmdFitLIPtrunc.m(2KB)
--------cmdExample.m(4KB)
--------cmdFitMT.m(2KB)
--------figure05.m(10KB)
----README.md(5KB)