BarleyMeta:脚本来重现Bulgarelli等人(2015年)的分析和数据

时间:2024-06-13 16:59:59
【文件属性】:

文件名称:BarleyMeta:脚本来重现Bulgarelli等人(2015年)的分析和数据

文件大小:343KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-13 16:59:59

R

大麦 野生和驯化大麦中细菌根微生物群的结构和功能 脚本可重现Bulgarelli等人(2015年)的分析和数据 如果您使用以下任何代码,请引用: Davide Bulgarelli,Ruben Garrido-Oter,PhilippC.Münch,Aaron Weiman,JohannesDröge,Yao Pan,Alice C.McHardy,Paul Schulze-Lefert,大麦和野生大麦中细菌根微生物群的结构和功能。 细胞宿主和微生物,2015年


【文件预览】:
BarleyMeta-master
----sliding_window.R(2KB)
----import_samples_from_folder.R(1KB)
----data()
--------barley_ncbi_names_order_or_above.txt(29KB)
--------taxonomy.txt(95KB)
--------NCBI_IDs_order.tree(1KB)
--------metagenome_ncbi_names_order_or_above.txt(2KB)
--------unweighted_unifrac.txt(26KB)
--------NCBI_names.tree(539B)
--------weighted_unifrac.txt(28KB)
--------mapping.txt(1KB)
--------at_count_matrix.txt(72KB)
--------barley_rotus_NCBI_IDs.txt(274B)
--------at_golm_rotus_NCBI_IDs.txt(392B)
--------at_golm_rotus_NCBI_names.txt(746B)
--------abundances_coverage_per_sample_order.tsv(8KB)
--------at_mapping.txt(5KB)
--------figure6()
--------barley_rotus_NCBI_names.txt(503B)
--------metagenome_ncbi_ids_order_or_above.txt(929B)
--------NCBI_IDs.tree(323B)
--------barley_ncbi_ids_order_or_above.txt(16KB)
--------NCBI_names_order.tree(3KB)
--------count_matrix.txt(126KB)
----script.R(900B)
----figure_6A1.R(3KB)
----figure_2_and_s2.R(11KB)
----reorder_phylo.c(4KB)
----README.md(483B)
----figure_6B.R(7KB)
----figure_4.R(7KB)
----cpcoa.plot.func.R(10KB)
----create_cluster_matrix.R(2KB)
----g_legend.R(191B)
----figure_6A2.R(3KB)
----tree.plot.func.R(26KB)
----figure_5.R(5KB)

网友评论