【文件属性】:
文件名称:Sepsis-diagnosis-from-pairwise-single-cell-RNA-Continued
文件大小:310.32MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-29 09:50:40
JupyterNotebook
从成对单细胞RNA进行败血症诊断
存储与此项目有关的所有相关代码。
数据预处理
-请检查“数据预处理”文件夹。
readdata.py包含数据预处理阶段的相关代码。 changefdrlimit.py在实验过程中更改Fdr阈值。 deleteSparseData.py会在实验期间更改稀疏阈值。 read_specgenes.py选择特定基因与其他生物标记进行比较。
模型训练
3s_series_trTran_CNN包含我们在课程中选择的模型的相关代码。 (Transformer + CNN,ESTR3108) NEW_NEW_capsnet.ipynb包含我们最新模型的相关代码。 (CapsuleNet +变压器)
型号比较
文件夹“ OTHER_MODELS”显示了我们训练用于比较的其他模型。 (可能包括相同的模型,但参数不同)
结果
屏幕截图和用于评估模型的图形位于“结果”文件夹中。