dokdo:使用QIIME 2进行微生物组测序分析的Python软件包

时间:2024-04-25 05:12:33
【文件属性】:

文件名称:dokdo:使用QIIME 2进行微生物组测序分析的Python软件包

文件大小:47KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-25 05:12:33

Python

独岛 Dokdo是用于微生物组测序分析的轻量级Python软件包,可以用作命令行工具和Python模块。 独岛设计用于 , 是一个强大的社区开发的微生物组生物信息学平台。 独岛就像瑞士军刀一样用途广泛。 例如,您可以使用其命令行界面为QIIME 2创建各种输入文件(例如清单文件或样本元数据文件)或执行各种辅助分析。 您也可以将的应用程序编程接口与一起使用,以使用QIIME 2的输出文件(例如,分类条形图或alpha稀疏图)创建具有出版质量的图形。 要安装独岛,请在终端中输入以下内容: $ git clone https://github.com/sbslee/dokdo $ cd dokdo $ pip install . 有关更多详细信息,请参阅,它是Dokdo的正式用户文档,包括说明,教程和其他重要信息。 该页面还记录了与QIIME 2相关的精选信息和资源,我认为这些信息和资源特


【文件预览】:
dokdo-master
----LICENSE(1KB)
----dokdo()
--------api()
--------__main__.py(9KB)
--------__init__.py(19B)
--------version.py(22B)
--------cli()
----setup.py(463B)
----.gitignore(2KB)
----CHANGELOG.md(4KB)
----README.md(1KB)

网友评论