文件名称：matlabsign函数代码-LCV:实现潜在因果变量模型的软件
文件大小：14KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 20:13:57
系统开源
matlab标志函数代码LCV（潜在因果变量模型） LCV是一种使用GWAS数据推断遗传因果关系的方法。 LCV在Matlab和R中实现。要运行LCV，您将需要LD分数（非分层，祖先与GWAS数据匹配），可以下载。 您还可以使用来计算自己的LD得分。 您还需要带符号的摘要统计信息：效果大小估计值（以每个标准化基因型效果大小为单位）或Z得分。 在源代码中描述了每个功能的用法。 在Matlab和R中有示例仿真脚本，在R中有基于真实数据的示例脚本。 内容： Matlab / example_script.m：用于在LCV模型下生成数据并在模拟数据上运行LCV的示例脚本 Simulate_LCV.m：模拟LCV模型下的因果效应大小和摘要统计信息 run_LCV.m：对两个特征的摘要统计信息运行LCV estimate_k4.m，weighted_mean.m，weighted_regression.m：run_LCV.m的子例程 run_LCV_parallel.m：对两个性状的摘要统计量运行LCV，并跨折刀块进行并行估计。 R / RunLCV.R：对两个特征的摘要统计信息运行LCV。 调用
【文件预览】：
LCV-master
----R()
--------ExampleSimulationScript.R(2KB)
--------ExampleRealdataScript.R(1KB)
--------RunLCV.R(5KB)
--------SimulateLCV.R(679B)
--------MomentFunctions.R(3KB)
----Matlab()
--------weighted_mean.m(190B)
--------simulate_LCV.m(3KB)
--------estimate_k4.m(4KB)
--------weighted_regression.m(248B)
--------run_LCV.m(6KB)
--------example_script.m(2KB)
----README.md(3KB)