文件名称:NET评估:网络评估包
文件大小:9KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-05 04:09:54
Shell
净评价 该软件包用于通过两种方法进行网络评估:(1)绑定数据,以及(2)基因本体分析。 运行此软件包的最简单方法是通过我们提供的奇异容器,可以在下载。 使用奇异容器,因为我们已经在容器中安装了所有必需的软件包,所以无需安装任何其他软件包。 方法1:通过奇点简化 1.安装奇点 请访问奇点以安装奇点2.4或更高版本。 2.从下载奇点容器 3.运行go命令进行GO富集分析 有关go命令的参数的信息: $ go -h 要运行命令本身,请参考以下玩具示例: $ cd ${path_of_code} $ go.sh --p_net_in ${path_of_network} --flag_singularity ON --p_singularity_bindpath ${path_of_data} --p_singularity_img ${path_of_singularity_image}
【文件预览】:
NET-evaluation-main
----.gitignore(13B)
----wrapper()
--------evaluate_with_go.sh(5KB)
--------helper_load_modules.sh(61B)
--------evaluate_with_binding.sh(236B)
----code()
--------evaluate_with_binding.py(6KB)
--------evaluate_with_go.R(8KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(1KB)
----go.sh(7KB)