文件名称：matlab扭曲矫正代码-Multicenter_Diffusion_Preprocessing:Multicenter_Diffusion_
文件大小：34KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 21:08:06
系统开源
matlab扭曲矫正代码 | 微信公众号：CBIST ZJU 多中心扩散预处理代码 概述 该代码在Linux系统上运行（已在CentOS 6.7中成功测试）。 需要以下软件： （仅用于面部去除） （可选的） （可选的） 脚本example.sh调用1） prep_diffusion.sh预处理参考文献中描述的扩散加权图像（DWI）； 2） prep_face_removal.sh在DWI和T1加权图像上剥离大脑颅骨。 在我们本地构建的高性能计算集群中，一次扫描处理此类数据需要花费7到9个小时。 特征 prep_diffusion.sh是基于FSL的组合式预处理流水线，主要使用TOPUP和EDDY来校正头部运动以及由b0不均匀性和涡流引起的变形。 它可以自动生成FSL命令所需的所有中间参数和文件。 如果图像满足以下要求，则此脚本还能够预处理其他扩散数据： b0图像应沿AP和PA包括相反的相位编码方向，沿每个方向至少需要一个图像。 序列的ACQ读出时间是已知的。 如果未定义，尽管校正输出不会受到影响，但估计的场图不会以Hz缩放。 prep_face_removal.sh是在T1加权图像和D
【文件预览】：
Multicenter_Diffusion_Preprocessing-master
----Prep_gibbsring.m(152B)
----CBIST_logo.png(42KB)
----example.sh(1KB)
----Prep_diffusion.sh(6KB)
----README.md(2KB)
----Prep_face_removal.sh(2KB)