文件名称：MedCAT：医疗概念注释工具
文件大小：1.65MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-21 06:24:18
nlp healthcare snomed ner umls
医疗类 oncept注释工具 MedCAT可用于从电子健康记录（EHR）中提取信息，并将其链接到SNOMED-CT和UMLS等生物医学本体。 预印 。 SNOMED演示 上提供了演示应用程序。 请注意，这是在MedMentions上进行的培训，并在CDB中使用SNOMED。 兴趣小组，问答 请使用“作为兴趣小组的类型，或在不提出问题的情况下放置问题和提出建议的地方。 讲解 文件夹中提供了有关如何使用MedCAT的。 阅读有关MedCAT的更多信息，以。 使用MedCAT的论文 相关项目 用于为生物医学领域文本构建，改进和定制给定的命名实体识别和链接（NER + L）模型（MedCAT）的界面。 将MedCAT NLP应用程序实现为REST API背后的服务。 在隔离环境中进行CogStack / MedCAT / HuggingFace开发的Docker容器。 使用PIP安装（需要Python 3.6.1+） 安装MedCAT pip install --upgrade medcat 获取割裂模型： pip install https://s3-us-west-2.amaz
【文件预览】：
MedCAT-master
----models()
--------README.md(32B)
----tutorial()
--------data()
--------README.md(3KB)
----medcat()
--------cogstack()
--------meta_cat.py(12KB)
--------basic_cat_ann.py(2KB)
--------cat.py(36KB)
--------default_config.py(3KB)
--------preprocessing()
--------LICENSE(1KB)
--------__init__.py(16B)
--------cat_ann.py(6KB)
--------cdb.py(24KB)
--------prepare_cdb.py(10KB)
--------spacy_cat.py(24KB)
--------utils()
----webapp()
--------webapp()
--------envs()
--------docker-compose.yml(286B)
--------README.md(179B)
----media()
--------cat-logo.png(103KB)
----envs()
--------env_medmen(320B)
--------env_umls(399B)
----requirements.txt(2B)
----examples()
--------complex_cdb.csv(326B)
----setup.py(1KB)
----.gitignore(324B)
----.dockerignore(32B)
----README.md(7KB)