文件名称:BioUtils Perl Library:Perl模块的集合,用于处理fasta / q序列和文件。-开源
文件大小:143KB
文件格式:GZ
更新时间:2024-05-20 13:45:44
开源软件
警告:BioUtils已迁移到Github(2017年11月)。 有关最新版本和信息,请访问:https://github.com/islandhopper81/BioUtils BioUtils是用于生物信息学中DNA序列分析的Perl模块的集合。 BioUtils是BioPerl的显着更快,内存效率更高的替代品。 但是,它的功能目前仅限于下面列出的功能。
【文件预览】:
BioUtils-v1.2.0
----t()
--------SeqSet()
--------Codec()
--------FastaSeq.t(10KB)
--------pod.t(170B)
--------FileReformat()
--------FastqSeq.t(13KB)
--------FastqIO.t(3KB)
--------ConsensusBuilder()
--------Align()
--------00.load.t(3KB)
--------FastaIO.t(2KB)
--------Entropy()
--------pod-coverage.t(202B)
--------QC()
----META.yml(3KB)
----lib()
--------BioUtils()
----Changes(2KB)
----Build.PL(1KB)
----META.json(5KB)
----MANIFEST(1KB)
----ignore.txt(118B)
----README(4KB)
----bin()
--------reverse_complement.pl(6KB)
--------filter_contaminants.pl(13KB)
--------fastq_filter.pl(12KB)
--------quals_to_ints.pl(5KB)