文件名称：docker-benchmarks:在Docker容器中运行的基因组管道的基准
文件大小：3.49MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-31 18:11:42
docker nextflow HTML
Docker基准测试 该存储库包含这些管道的基准测试： 快速开始 要从原始数据复制图，请克隆此存储库： git clone https://github.com/cbcrg/docker-benchmarks.git && cd docker-benchmarks 然后拉出所需的Docker映像： docker pull cbcrg/make-peerj5515 最后，使用以下命令启动make脚本： docker run -v $PWD:$PWD -w $PWD cbcrg/make-peerj5515 bash make-all.sh （如果您不想或不能使用Docker，则需要下载并安装所需的依赖项：R，Datamash，Make和Groovy。有关配置的详细信息，请参阅随附的 ）。 资料库的结构 根据执行的管道，基准脚本和数据被组织在单独的文件夹中： 这些文件夹中的每一个都