motiflocation:在 FASTA 文件中查找主题位置的小程序

【文件属性】：

文件名称：motiflocation:在 FASTA 文件中查找主题位置的小程序

文件大小：17KB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-08-06 08:56:13

C++

基序定位 一个在 FASTA 文件中查找主题位置的小程序。 用法 要编译，您应该只需要键入“make”即可。 用法如下： ./motiflocation -file1 -startstr -out 参数 -file1 ：指定输入的 fasta 文件。 -startstr ：指定要在 fasta 文件中查找的主题。 -out : 指定输出文件 可选参数 -chr ：指定运行算法的染色体。 -mutations ：指定查找模体时允许的突变（不匹配）数量。 -uppercase_only ：只报告大写匹配。 -lowercase_only ：只报告小写匹配。 输出 该程序生成一个包含 5 列的输出文件。 染色体 母题开始位置 母题结束位置 斯特兰德 基序

【文件预览】：
motiflocation-master
----motif.cpp(9KB)
----random.h(451B)
----tools.cpp(326B)
----test.fa(5KB)
----random.cpp(5KB)
----tools.h(162B)
----gzstream.cpp(5KB)
----DNA.cpp(6KB)
----gzstream.h(4KB)
----Makefile(172B)
----motif.h(976B)
----README.md(833B)
----motiflocation.h(234B)
----motiflocation.cpp(5KB)
----DNA.h(1KB)