文件名称：pyEntrezId:将Ensembl，Uniprot和HGNC ID转换为Entrez基因ID
文件大小：11KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-22 13:36:32
Python
PyEntrezId Python软件包可在各种基因或蛋白质ID之间进行转换 概括 这是我发布的第一个程序包。 任何反馈将不胜感激！ 我希望该项目可以作为初学者的示例，说明如何构造/编码简单的生物信息学工具。 我创建此程序包的原因是，我需要一个简单的工具来在用于标识基因，蛋白质等的多个ID之间进行转换。这之所以重要，是因为各种科研机构（NIH，EMBL等）托管的数据库有时具有不同的命名法描述相同的事物（基因，蛋白质，DNA，RNA等）。 讨论链接 Reddit：< > 快速开始 $ pip install --upgrade pyEntrezId 例子 将Ensemble转录本基因ID转换为Entrez基因ID from PyEntrezId import Conversion EnsemblId = 'ENST00000407559' # include your email a
【文件预览】：
pyEntrezId-master
----setup.py(1KB)
----.gitignore(50B)
----requirements.txt(119B)
----.travis.yml(168B)
----dist()
--------PyEntrezId-1.5.8.2.tar.gz(3KB)
----LICENSE(1KB)
----setup.cfg(41B)
----PyEntrezId()
--------__init__.py(35B)
--------Conversion.py(6KB)
----README.rst(4KB)
----tests()
--------__init__.py(0B)
--------tests.py(1KB)
----index.html(330B)
----CONTRIBUTING.rst(234B)
----MANIFEST(135B)