文件名称：BioCAT:NRP的生物合成基因簇逆向预测因子
文件大小：34.35MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-01 17:47:16
Python
BioCAT：nrp生物合成指标分析工具 该工具将有助于找到具有非核糖体生物合成途径的物质的生物合成基因（BGC）簇。 安装以下依赖项： rBAN（1.0-版本） antismash（已通过5.1.1测试，使用较小的版本可能会出现问题） python3（版本3.8） python3库： numpy（版本1.19.2） 熊猫（版本1.1.3） Biopython（版本1.78版） scikit-learn（版本0.23.2） 使用方法 $ python3 BioCAT.py -h
【文件预览】：
BioCAT-main
----HMM()
--------gln()
--------gly()
--------dhb()
--------pro()
--------dhpg()
--------thr()
--------ile()
--------bht()
--------hpg()
--------asp()
--------phe()
--------cys()
--------asn()
--------glu()
--------tyr()
--------ala()
--------val()
--------leu()
--------orn()
--------ser()
----BioCAT.py(9KB)
----OUTPUT()
--------Surfactine.bad(90B)
--------Surfactine.smi(131B)
----antiSMASH_parser.py(5KB)
----LICENSE(1KB)
----HMM_maker.py(2KB)
----PSSM_maker.py(3KB)
----README.md(530B)