文件名称：rRNA_counter：计算和比较基因组中的16S rRNA基因
文件大小：27KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-03 16:11:29
Perl
rRNA_计数器 计数和比较属或种内的16S rRNA基因 接受输入属并返回大量分析文件，主要是全长16S rRNA基因的系统树及其常见的扩增子。 这对于使用通用的元分类学方法确定某个属内的物种解析是否可能是有用的 安装 ＃从github克隆 git clone ＃创建conda环境表单yml文件 conda env创建-f rRNA_counter / rRNA_counter.yml ＃激活conda环境 conda激活rRNA_counter ＃设置文件的可执行权限 chmod 755 rRNA_counter / * ＃使并行引用消息静音（并根据您的需要处理该消息） 并行引用 注意：in_silico_PCR.pl是从借用的 用法 ＃按以下方式运行分析 到rRNA_counter / rRNA_counter.sh的路径-g $ genus ＃以Ruegeria作为
【文件预览】：
rRNA_counter-master
----rRNA_counter.yml(12KB)
----Format16STrees.R(2KB)
----rRNA_counter.sh(6KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(3KB)
----run16sSummary.R(2KB)
----in_silico_PCR.pl(18KB)