文件名称:SDA:分段复制汇编程序(SDA)
文件大小:58.5MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-06 23:22:17
Python
分段复制汇编程序(SDA) 下载: git clone --recurse-submodules https://github.com/mrvollger/SDA.git 安装: SDA的要求由两个自定义的conda环境(sda-python-2和sda-python-3)处理。 为了运行SDA,您必须已经在系统上安装了anaconda 3,并且必须能够创建conda环境。 完成后,创建env_sda.sh以便将env_sda.sh添加到您的路径中。 此外,还没有通过env_sda.sh为您安装RepeatMasker,gcc和cmake,必须将其加载到env_sda.sh 。 最后,例如,如果RepeatMasker依赖于perl模块,则还必须将其添加到env_sda.sh注意:1)安装Racon cmake必须可用。 2)要运行SDA denovo ,必须有一个具有ncbi引擎