【文件属性】:
文件名称:repro-fair-neuro-ds-template:神经重症监护DataScience研究项目模板
文件大小:2.29MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-02-12 17:15:17
docker tidyverse rmarkdown drake pkgdown
可重现的临床研究项目模板
作者:卢卡斯·胡伯(Lukas Huber)
语境
该模板可以用作观察性临床研究中可追溯分析的通用起点。
文献资料
该模板为数据科学的FAIR环境设置了可重现的模板。 可以在不同的可重复性水平上使用它。 它使用Docker,R,RMarkdown,Git,德雷克,mandrake,pkgdown,roxygen,roxytest和Github Actions。
该模板面向具有技术和非技术背景的合作者,而运行该模板的最低要求是安装docker。
过程
(下一步
后续分析步骤的说明。 如何使用此套件:
首先克隆/分支git仓库
使用git + github,git lfs,tidyverse和RMarkdown
将Drake计划添加到您的管道
(可选)在Docker中启动RStudio IDE +使用renv
数据集
数据来源和历史的描述在这里。
码
执行-