文件名称：磁共振成像
文件大小：4.96MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-14 10:44:21
R
MRAPSS MRAPSS软件包采用MR-APSS方法来测试暴露与结局疾病之间的因果关系。 MR-APSS是使用全基因组汇总统计数据对多效性和样品结构进行说明的孟德尔随机化的统一方法。 具体而言，MR-APSS使用背景-前景模型来表征SNP暴露效应和SNP-结果效应，其中背景模型从遗传相关性和样本结构中考虑混杂因素，而前景模型则捕获有效信号以进行因果推理。 安装 #install.packages("devtools") devtools::install_github("YangLabHKUST/MR-APSS") 用法 我们通过一个真实的例子，即BMI（UKB）（曝光）和T2D（结果），说明了如何使用MRAPSS软件分析GWAS摘要级别数据。 MRAPSS分析包括以下步骤： 第1步：准备数据并估算有害参数 步骤2：将MRAPSS设置为因果侵权 [修订]教程：提供了每个步骤的详细信
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MR-APSS-master
----NAMESPACE(180B)
----DESCRIPTION(1KB)
----R()
--------est_h2_funcs.R(7KB)
--------allele_complement.R(151B)
--------MRAPSS_EM_funcs.R(8KB)
--------est_gencov_funcs.R(10KB)
--------MRplot.R(2KB)
--------MRAPSS.R(6KB)
--------est_paras.R(4KB)
--------Format_data.R(12KB)
--------ldsc_GC.R(7KB)
--------clump.R(2KB)
----example()
--------BMI_ukb~T2D_dia_CAUSE_clumped(588KB)
--------BMI_ukb~T2D_dia_CAUSE_paras.RData(3KB)
--------realdata_example.R(4KB)
----README.md(3KB)
----data()
--------w_hm3.snplist.rda(4.33MB)
--------C.rda(127B)
--------MHC.SNPs.rda(407KB)
--------Omega.rda(137B)
--------MRdat.rda(57KB)
----man()
--------clump.Rd(1KB)
--------MRplot.Rd(492B)
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--------MRAPSS.Rd(3KB)
----MRAPSS.Rproj(386B)