matlab代码影响-collective-invasion:Ewald等人为AMIGOS项目编写的代码

时间:2024-06-11 01:34:30
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文件名称:matlab代码影响-collective-invasion:Ewald等人为AMIGOS项目编写的代码

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更新时间:2024-06-11 01:34:30

系统开源

matlab代码影响基于细胞的建模框架中的细胞外基质建模 在PhysiCell中实现的细胞外基质(ECM)模型。 概述 使用基于C ++编写的基于开源单元的多单元3-D建模框架构建ECM模型。 如果您还不熟悉PhysiCell,请先对其进行检查(请参阅下面的参考和安装部分),然后再深入了解此处的建模代码。 ECM模型具有三个组成部分: density (纤维的相对数量), anisotropy (对齐协议)和fiber orientation ( fiber orientation总体取向)。 在示例代码中,我们在模型中使用两种不同的单元格类型:前导单元(K14 +)和后继单元(K14-)。 前导细胞可以影响ECM,但不受ECM的影响,而跟随细胞则受ECM影响,但不能对其进行更改。 模型 ECM被认为是由一组小的ECM单元组成的,其属性可以由3个分量表示,该3个分量表示该小单元上每个分量的平均值。 这些ECM成分能够影响ECM敏感细胞的运动,进而可以被细胞改变。 density (范围为0-1的标量)表示存在多少总纤维相对于可用纤维填充多少空间, fiber orientation (


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