Bio-Cigar:解析 CIGAR 字符串并将坐标转换为参考查询

时间:2024-07-22 21:00:37
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文件名称:Bio-Cigar:解析 CIGAR 字符串并将坐标转换为参考查询

文件大小:16KB

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更新时间:2024-07-22 21:00:37

Perl

名称 Bio::Cigar - 解析 CIGAR 字符串并将坐标转换为/从参考/查询 概要 use 5.014; use Bio::Cigar; my $cigar = Bio::Cigar->new("2M1D1M1I4M"); say "Query length is ", $cigar->query_length; say "Reference length is ", $cigar->reference_length; my ($qpos, $op) = $cigar->rpos_to_qpos(3); say "Alignment operation at reference position 3 is $op"; 描述 Bio::Cigar 是一个小型库,用于解析 CIGAR 字符串(“Compact Idiosyncratic Gapped Alignment Report


【文件预览】:
Bio-Cigar-master
----cpanfile(208B)
----t()
--------basic.t(5KB)
----LICENSE(18KB)
----Makefile.PL(1KB)
----META.json(2KB)
----.gitignore(91B)
----lib()
--------Bio()
----README.md(4KB)
----Changes(240B)
----dist.ini(31B)

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