文件名称：pypdb:RCSB蛋白质数据库（PDB）的Python API
文件大小：49KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-20 08:45:21
proteins pdb protein-data-bank protein-structure protein-sequences
PyPDB 使用RCSB蛋白质数据库（PDB）执行搜索的Python 3工具箱。 这可用于对符合各种条件的PDB ID执行高级搜索，以及查找与特定PDB ID相关的信息。 该工具允许在Python脚本中执行可以在PDB网站中执行的标准操作（BLAST，PFAM查找等）。 每个函数及其相关输出的示例可以在找到。 如果您将此模块用于任何已发表的作品，请考虑引用随附的论文 Gilpin, W. "PyPDB: A Python API for the Protein Data Bank." Bioinformatics, Oxford Journals, 2015. 截至2020年11月，为了适应RCSB PDB API的更改并扩展功能，pypdb正在进行大量重构。 对于此过程中发生的任何重大变化，我们深表歉意。 pypdb的先前版本可； 但是，它将不再对更改的RCSB API起
【文件预览】：
pypdb-master
----demos()
--------demos.ipynb(40KB)
----LICENSE(1KB)
----devtools()
--------conda-recipe()
----setup.cfg(39B)
----setup.py(748B)
----README.md(3KB)
----pypdb()
--------pypdb.py(33KB)
--------__init__.py(49B)
--------util()
--------clients()
--------conftest.py(57B)
----MANIFEST(77B)
----tests()
--------test_pypdb.py(2KB)
----.gitignore(968B)