文件名称：pypiper:用于构建可重新启动管道的Python工具包
文件大小：219KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-13 07:28:39
python bioinformatics pipeline bioinformatics-pipeline python-toolkit
y 一个轻量级的python工具包，用于将可重新启动的，健壮的Shell管道粘合在一起。 在了解更多。
【文件预览】：
pypiper-master
----setup.py(3KB)
----.gitignore(986B)
----logo_pypiper.svg(7KB)
----example_pipelines()
--------logmuse_example.py(4KB)
--------count_reads.py(4KB)
--------basic.py(2KB)
--------hello_pypiper.py(533B)
----.travis.yml(331B)
----MANIFEST.in(65B)
----init_interactive.py(316B)
----setup.cfg(23B)
----LICENSE.txt(1KB)
----docs_jupyter()
--------hello-world.ipynb(5KB)
--------build()
--------basic-pipeline.ipynb(14KB)
----README.md(567B)
----tests()
--------conftest.py(3KB)
--------test_pipeline_filepath.py(3KB)
--------__init__.py(0B)
--------pipeline_manager()
--------utils_tests()
--------helpers.py(2KB)
--------pipeline()
--------test_packaging.py(720B)
----design-notes.md(2KB)
----pypiper()
--------pipeline.py(18KB)
--------stage.py(3KB)
--------__init__.py(291B)
--------ngstk.py(75KB)
--------folder_context.py(1KB)
--------manager.py(96KB)
--------utils.py(36KB)
--------flags.py(355B)
--------_version.py(23B)
--------exceptions.py(3KB)
--------const.py(212B)
----mkdocs.yml(1KB)
----requirements()
--------reqs-pypiper.txt(67B)
--------reqs-build-release.txt(32B)
--------reqs-docs.txt(111B)
--------reqs-plot.txt(25B)
--------reqs-ngstk.txt(26B)
--------reqs-test.txt(82B)
----docs()
--------philosophy.md(4KB)
--------report.md(3KB)
--------outputs.md(2KB)
--------best-practices.md(2KB)
--------contributing.md(514B)
--------conf.py(11KB)
--------configuration.md(3KB)
--------cli.md(6KB)
--------changelog.md(7KB)
--------features.md(3KB)
--------faq.md(3KB)
--------clean.md(1KB)
--------README.md(3KB)
--------support.md(117B)
--------ngstk_intro.md(1KB)
--------advanced-run-method.md(6KB)
--------img()