文件名称：gatk-sv
文件大小：15.72MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-07 22:13:29
wdl
GATK-SV 用于Illumina短读全基因组测序（WGS）数据的结构变异发现管道。 目录 原始呼叫者和证据收集 批量质量控制 -gCNV模型创建 批量证据合并，BAF生成和深度调用者 网站集群 网站指标 过滤 跨批次站点合并 基因分型 基因型优化（可选） 跨批次集成，复杂事件解决和VCF清理 下游过滤 注释 质量控制和可视化 附加模块-Mosaic和de novo 部署和执行： 一个帐户。 支持（WDL）的流执行系统，可以： （v36或更高版本）。强烈建议使用专用服务器。 或 （请注意，此平台尚不支持预配置的GATK-SV工作流程） 推荐： 。由于许可限制，我们无法为此算法提供公共docker映像或参考面板VCF。 推荐：用于与专用Cromwell服务器进行交互的 。 推荐：用于验证WDL / json文件的 。 数据： Illumina短读全基因组CRAM或BAM，与带有hg38