文件名称：CyGNAL:用于分析和可视化CyTOF数据集的管道，重点是PTM信令网络
文件大小：18.78MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-19 16:37:28
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CY TOF硅GN阿灵的人ysis（CYGNAL） 在此存储库中，我们介绍了CyGNAL ，这是一种用于分析大规模细胞计数数据的管道，类似于我们在《自然方法》论文中使用的管道：。 使用Python和R中的代码，CyGNAL假定通过平台进行了一些初步的和跨步骤的处理（尽管理论上用户可以针对此步骤和门控步骤使用任何其他解决方案）。 标准质谱分析中的CyGNAL（蓝色虚线）概述： 使用CyGNAL CyGNAL作为多级目录分发。 “ code”文件夹包含主要步骤，以及在“ code / utils /”中找到的其他实用程序脚本。 输入数据应添加到“ Raw_Data”以进行预处理，处理后的数据集将存储在“ Preprocessed_Data”中。 用于分析和可视化步骤的输入和输出目录位于“分析”目录中。 输入数据 原始数据包含样本数据集文件。 管道可以同时接收FCS和.txt文件（以制表符