文件名称：cnvnatorWrapper:用于在多个 bam 文件上自动运行 cnvnator 的简单包装脚本
文件大小：876.31MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-17 05:44:32
C++
cnvnatorWrapperl.pl cnvnatorWrapper.pl 是一种 perl 脚本，旨在自动并行运行 cnvnator 一个或多个 bam 文件。 它与此程序捆绑的 CNVnator 或 ROOT 无关。 注意：在运行 cnvnatorWrapper.pl 时，您必须使用 bash 作为 shell，以允许正确获取环境变量。 如果需要，它应该很容易被破解以允许其他 shell。 安装 在解压缩“fasta”文件夹中的染色体 fasta 文件（例如“gzip -d fasta/*.gz”）后，该版本应该在 64 位 Debian 7 上运行。 对于其他系统，您必须重新编译 CNVnator 和 ROOT（或为您的系统下载适当的二进制文件）。 要在不同的系统上进行设置，请按照 CNVnator_v0.3/README 中的说明重新编译 CNVnator。 然后，您需要