vcfcompare:使用hap.py和nextflow比较VCF

时间:2024-04-20 04:05:28
【文件属性】:

文件名称:vcfcompare:使用hap.py和nextflow比较VCF

文件大小:1.61MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-20 04:05:28

Nextflow

vcfcompare 使用光源和比较 如果不存在,请安装nextflow 请参阅 如果不存在则安装docker 请参阅 从Docker Hub获取hap.py Docker映像 docker pull pkrusche/hap.py:v0.3.9 singularity build hap.py_v0.3.9.img docker://pkrusche/hap.py:v0.3.9 (if prefer singularity) 取得验证码 git clone https://github.com/oxfordfun/vcfcompare 运行测试 nextflow run compare.nf -profile docker 测试默认参数(在nextflow命令行中设置自己的参数) --input tests/input (folder with vcf f


【文件预览】:
vcfcompare-master
----.gitignore(61B)
----nextflow.config(590B)
----compare.nf(2KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(3KB)
----tests()
--------input-zip()
--------ref()
--------input()

网友评论