文件名称:TCC-GUI:T TCC封装的图形用户界面
文件大小:12.2MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-30 14:45:39
gui bioinformatics rna-seq shiny tcc
:bar_chart: TCC-GUI:TCC软件包的图形用户界面 1是一种 / 软件包,提供了一系列功能,可使用强大的归一化策略(称为DEGES )从RNA序列计数数据中进行差异表达( DE )分析。 DEGES的基本思想是,在进行数据归一化之前,应删除比较样本中潜在的差异表达基因( DEG ),以获得基因排序正确的基因列表,其中真正的DEG排名最高,而非DEG排名最低。 这可以通过执行基于TCC中实现的DEGES ( DEG消除策略)的多步骤归一化过程来完成。 TCC在内部使用 2 , 3和 4提供的功能。 可以通过使用四个软件包中的函数来完成TCC的多步归一化。 在此GUI version of TCC (TCC-GUI) ,所有参数设置均可用,就像您使用的是原始设置一样。 此外,它还提供了许多绘图功能,这些功能现在不支持原始软件包。 提示:开发正在进行中,某些功能在最终版本中可能会更改。