Parallel BWA [pBWA]-开源

时间:2024-06-24 12:56:40
【文件属性】:

文件名称:Parallel BWA [pBWA]-开源

文件大小:154KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-24 12:56:40

开源软件

使用 OpenMPI 库并行实现 BWA (http://bio-bwa.sourceforge.net/)。


【文件预览】:
pBWA_1.21009
----qualfa2fq.pl(616B)
----bwtsw2_main.c(4KB)
----bntseq.c(9KB)
----bwtsw2_chain.c(3KB)
----khash.h(16KB)
----bntseq.h(2KB)
----bwt_lite.c(3KB)
----kvec.h(3KB)
----bwtio.c(3KB)
----bwtsw2_core.c(17KB)
----bwtaln.c(13KB)
----bwtsw2_aux.c(20KB)
----main.c(3KB)
----bamlite.h(2KB)
----bwt_lite.h(674B)
----bwt.c(8KB)
----bwt_gen()
--------bwt_gen.c(49KB)
--------QSufSort.c(14KB)
--------QSufSort.h(2KB)
--------bwt_gen.h(4KB)
--------Makefile(395B)
--------libbwtgen.a(49KB)
----bwape.c(33KB)
----bwtgap.c(9KB)
----kseq.h(7KB)
----bwtgap.h(942B)
----bwaseqio.c(12KB)
----stdaln.c(35KB)
----bwase.c(24KB)
----kstring.h(825B)
----kstring.c(641B)
----utils.c(2KB)
----solid2fastq.pl(3KB)
----simple_dp.c(5KB)
----stdaln.h(5KB)
----Makefile.sgi(1KB)
----bwase.h(960B)
----bwt.h(4KB)
----bamlite.c(5KB)
----bwtmisc.c(7KB)
----bwtindex.c(6KB)
----main.h(668B)
----utils.h(2KB)
----Makefile(1KB)
----cs2nt.c(6KB)
----bwtsw2.h(977B)
----is.c(6KB)
----ksort.h(9KB)
----COPYING(34KB)
----bwtaln.h(4KB)

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