文件名称:bwa_pipeline
文件大小:19KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-06 19:36:45
Python
bwa_pipeline
【文件预览】:
bwa_pipeline-master
----get_barcode.sh(215B)
----config.json(569B)
----create_samples.sh(407B)
----scripts()
--------analyse_contamination.py(5KB)
--------multifasta_to_fasta.sh(326B)
--------create_samples.sh(407B)
--------demultiplexing.sh(2KB)
--------compute_coverage.sh(472B)
--------__init__.py(0B)
--------contaminant_utils.py(8KB)
--------illumina_demultiplexing.sh(172B)
--------convert_to_unaigned_fasta.sh(97B)
--------plot_coverage.gnu(172B)
----pipeline.md(2KB)
----Snakefile(16KB)
----templates()
--------contamination.html(2KB)
----envs()
--------linux.yml(10KB)
----mount_bs.sh(117B)