bwa-docker:bwa 的最小泊坞窗图像。 不再开发

时间:2024-06-29 23:30:10
【文件属性】:

文件名称:bwa-docker:bwa 的最小泊坞窗图像。 不再开发

文件大小:542KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-29 23:30:10

在这个 repo 中, bwa是一个静态链接的二进制文件(即与gcc -static链接)。 要构建 docker 镜像,请在此目录中运行以下命令: docker build -t mybwa . 为 MT.fa 创建 BWA 索引: docker run -v ` pwd ` :/tmp -w /tmp mybwa index MT.fa 运行 BWA-MEM: docker run -v ` pwd ` :/tmp -w /tmp mybwa mem MT.fa test.fq > test.sam 您也可以使用管道: cat test.fq | docker run -iv ` pwd ` :/tmp -w /tmp mybwa mem MT.fa /dev/stdin > test.sam 此 github 存储库也已链接到 Docker Hub 上的 。 您可以使


【文件预览】:
bwa-docker-master
----MT.fa(16KB)
----Dockerfile(46B)
----test.fq(6KB)
----README.md(845B)
----bwa(1.09MB)

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