RSSS:RNA-seq分析策略的比较研究

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文件名称：RSSS:RNA-seq分析策略的比较研究
文件大小：40KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-30 10:04:53
Python RNA-seq分析策略的比较研究 该存储库包含用于模拟 RNA-seq 分析的管道，发表于： Jänes J、Hu F、Lewin A 和 Turro E。RNA 生物信息学简报，2015 年 3 月。doi:10.1093/bib/bbv007。 获得 要下载源代码，请使用 git 下载最新的开发树。 目前，该树托管在 github 上，可以通过以下方式获得： git clone git://github.com/boboppie/RSSS.git 用法 下载数据（详见 data/README.txt） 安装所有预先需要的软件 将RSSS_DATA_DIR环境变量设置为包含Ensembl数据的路径 使用适当的选项执行run_pipeline.sh ：例如run_pipeline.sh -c计算和可视化不同覆盖值的转录组重建精度，或run_pipeline.sh -s比较灵敏度和

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RSSS-master
----README.md(1KB)
----misc()
--------transcript_pool_estimation()
--------ens.R(2KB)
--------isoform()
--------paralog.R(2KB)
----src()
--------run_pipeline.sh(2KB)
--------test_pipeline()
--------sens_prec()
--------coverage()
--------core()
----data()
--------README.txt(2KB)